RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 FAM205CA6NFA0 338 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 BUB1O43683 1085 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 GUCY1A2P33402 732 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRT-211ENST00000618610 CUL4BQ13620 913 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRT-211ENST00000618610 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
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PTPRT-211ENST00000618610 EPAS1Q99814 870 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ARMT1Q9H993 441 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 EBF2Q9HAK2 575 aa9.04□□□□□ -0.96
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PTPRT-211ENST00000618610 SNX12Q9UMY4 172 aa9.04□□□□□ -0.96
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PTPRT-211ENST00000618610 MCAMP43121 646 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 KCNJ12Q14500 433 aa9.04□□□□□ -0.96
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PTPRT-211ENST00000618610 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.03□□□□□ -0.96
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PTPRT-211ENST00000618610 POLE2P56282 527 aa9.03□□□□□ -0.96
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PTPRT-211ENST00000618610 TRAPPC3O43617 180 aa9.03□□□□□ -0.96
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PTPRT-211ENST00000618610 OXER1Q8TDS5 423 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM37O94972 964 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 PAK2Q13177 524 aa9.02□□□□□ -0.97
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