RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	MCM6	Q14566	821 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PROSER3	Q2NL68	480 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	DONSON	Q9NYP3	566 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649		M0R2C6	588 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CIITA	P33076	1130 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TTC1	Q99614	292 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	GBP1	P32455	592 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PTGDR	Q13258	359 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SUSD4	Q5VX71	490 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TIGD1	Q96MW7	591 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	JAK2	O60674	1132 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	LMNB1	P20700	586 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RRAGA	Q7L523	313 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RDH13	Q8NBN7	331 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TRIM58	Q8NG06	486 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	DISC1	Q9NRI5	854 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CMA1	P23946	247 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ELF1	P32519	619 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	MAGEA1	P43355	309 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SP8	Q8IXZ3	490 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	URGCP	Q8TCY9	931 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CEP170P1	Q96L14	293 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25	4e-6	■■■■□ 21
ACACA-240	ENST00000617649	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SORBS3	O60504	671 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ARMCX2	Q7L311	632 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PPP6R2	O75170	966 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CIB2	O75838	187 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	MAN1A1	P33908	653 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CDK8	P49336	464 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ADAM9	Q13443	819 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	NT5C1B	Q96P26	610 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SMIM23	A6NLE4	172 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	LMNB2	Q03252	620 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	STXBP2	Q15833	593 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	WRNIP1	Q96S55	665 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	APOL6	Q9BWW8	343 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PFKFB1	P16118	471 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PNOC	Q13519	176 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TTLL4	Q14679	1199 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ZBTB7A	O95365	584 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	MYL3	P08590	195 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TNFAIP2	Q03169	654 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	BBOF1	Q8ND07	529 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ITK	Q08881	620 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PAK2	Q13177	524 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PSMD2	Q13200	908 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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