RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 GBF1Q92538 1859 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA8BA8MQT2 603 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TRANK1O15050 2925 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR46O15213 610 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TLR3O15455 904 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ASPRV1Q53RT3 343 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP2R2DQ66LE6 453 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 RIOX2Q8IUF8 465 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM126BQ8IXS8 530 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 VTI1AQ96AJ9 217 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PDHBP11177 359 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP2C18P33260 490 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 GRM4Q14833 912 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 COG5Q9UP83 839 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 MYADML2A6NDP7 307 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ASGR1P07306 291 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC1A4P43007 532 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 GNAQP50148 359 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 MICU3Q86XE3 530 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 C11orf16Q9NQ32 467 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA8AA7E2F4 631 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TLL1O43897 1013 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 BMP3P12645 472 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF543Q08ER8 600 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 OTOP2Q7RTS6 562 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SPICE1Q8N0Z3 855 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 FANCBQ8NB91 859 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PFKFB2O60825 505 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CD4P01730 458 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 STAT3P40763 770 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 RABGGTBP53611 331 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 RTN1Q16799 776 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SPC25Q9HBM1 224 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 RAD21O60216 631 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PLA2G6O60733 806 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 COPB2P35606 906 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC96Q2M329 555 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 HSCBQ8IWL3 235 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCA1P28370 1054 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 MYL10Q9BUA6 226 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PARP14Q460N5 1801 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 MYOGP15173 224 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ME3Q16798 604 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM160B2Q86V87 743 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 HIPK3Q9H422 1215 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 MAD2L2Q9UI95 211 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 FEM1BQ9UK73 627 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 MTMR7Q9Y216 660 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 GJA9P57773 515 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 GNASQ5JWF2 1037 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 CHURC1Q8WUH1 139 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF3C6Q969F1 213 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 TMX3Q96JJ7 454 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM86C2PA6NEL3 165 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 VWA5AO00534 786 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 BECN1Q14457 450 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 BTNL9Q6UXG8 535 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
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