RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 Q6ZUG5 572 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN6-206ENST00000590466 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN6-206ENST00000590466 SPC25Q9HBM1 224 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN6-206ENST00000590466 PXMP2Q9NR77 195 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN6-206ENST00000590466 MOXD2PA6NHM9 499 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 RTP1P59025 263 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 GNASQ5JWF2 1037 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 TLK2Q86UE8 772 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 POLR2MP0CAP2 368 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 RTN1Q16799 776 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 BRF1Q92994 677 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 PRO3102Q9H379 93 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 CEP290O15078 2479 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 ASGR1P07306 291 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 NR3C2P08235 984 aa23.37■■□□□ 1.33
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UBXN6-206ENST00000590466 CDC27P30260 824 aa23.37■■□□□ 1.33
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UBXN6-206ENST00000590466 APOBRQ0VD83 1088 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 SCFD2Q8WU76 684 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 EVCP57679 992 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 FGD1P98174 961 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 STXBP2Q15833 593 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 TRIM60Q495X7 471 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 RUFY3Q7L099 469 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 ELP1O95163 1332 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 ARIH2O95376 493 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 SYN1P17600 705 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 PPP2R5BQ15173 497 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 PIK3CDO00329 1044 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 MEIS2O14770 477 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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UBXN6-206ENST00000590466 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 IL31RAQ8NI17 732 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 GDF15Q99988 308 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 NID2Q14112 1375 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 RGS20O76081 388 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 TLE2Q04725 743 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 PGM5Q15124 567 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 COPS5Q92905 334 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-206ENST00000590466 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.328e-7■■□□□ 14.3
UBXN6-206ENST00000590466 CDK7P50613 346 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 TTLL4Q14679 1199 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 TOX2Q96NM4 488 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 A6NJR5 290 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 ZEB2O60315 1214 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 CABYRO75952 493 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 LY6KQ17RY6 165 aa23.3■■□□□ 1.32
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