RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 INCENPQ9NQS7 918 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 STX6O43752 255 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 MAN1A2O60476 641 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PDHBP11177 359 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 GJB2P29033 226 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 GNA11P29992 359 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 BACE1P56817 501 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF543Q08ER8 600 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 FSTL1Q12841 308 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 NR1H3Q13133 447 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC96Q2M329 555 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 NECAB1Q8N987 351 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 C8orf76Q96K31 380 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ARID3AQ99856 593 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 MYPNQ86TC9 1320 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 NMT2O60551 498 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 GDF11O95390 407 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PTPRAP18433 802 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 COPB2P35606 906 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 GMPRP36959 345 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 STAT2P52630 851 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 INHBEP58166 350 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PPIL2Q13356 520 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 BRAPQ7Z569 592 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 MB21D1Q8N884 522 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 C12orf42Q96LP6 360 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CFAP45Q9UL16 551 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 MYH4Q9Y623 1939 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 TTLL8A6PVC2 850 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L15C9J2P7 530 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L11C9JVI0 530 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L18D6R9N7 530 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L22D6RA61 530 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L19D6RCP7 530 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L20D6RJB6 530 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 RAD21O60216 631 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZBED4O75132 1171 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 TOMM70O94826 608 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 BMP15O95972 392 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 NDUFB10O96000 172 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ADH1AP07327 375 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SCG2P13521 617 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SYT1P21579 422 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 OAZ1P54368 228 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L24Q0WX57 530 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SNAPC2Q13487 334 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 NTRK3Q16288 839 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 IRF7Q92985 503 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ALG1Q9BT22 464 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZMYND15Q9H091 742 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 C6orf50Q9HD87 102 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ESYT2A0FGR8 921 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 FAM196BA6NMK8 535 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ADM5C9JUS6 153 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZBTB5O15062 677 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CETPP11597 493 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms