RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587878.1

ATP9B-211, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), humanhuman

TSL 3

Gene ATP9B, Length 344 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9B-211ENST00000587878 PRAMEF1O95521 474 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 TCIRG1Q13488 830 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 INAVAQ3KP66 663 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 C4orf46Q504U0 113 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SLC5A5Q92911 643 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 IL17RAQ96F46 866 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 RRAGCQ9HB90 399 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 USP25Q9UHP3 1055 aa7.12□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 WDR64B1ANS9 1081 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 STXBP3O00186 592 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 LTFP02788 710 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 CKMP06732 381 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 NFICP08651 508 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 PF4V1P10720 104 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 RBP3P10745 1247 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 PAMP19021 973 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 GTF2A2P52657 109 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 ERVK-21P61565 698 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 CRY1Q16526 586 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 DDB1Q16531 1140 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 EFHBQ8N7U6 833 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SLC39A13Q96H72 371 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 AIFM3Q96NN9 605 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 MMP19Q99542 508 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SARGQ9BW04 601 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 MKS1Q9NXB0 559 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.11□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 ANO9A1A5B4 782 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 F8W735 103 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 LRRN2O75325 713 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SOD2P04179 222 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SLURP2P0DP57 97 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 BMP8BP34820 402 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 DNM2P50570 870 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 CYP4F3Q08477 520 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 ZNF174Q15697 407 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 PJA1Q8NG27 643 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 IRF7Q92985 503 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.1□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 CCDC66A2RUB6 948 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 KLHL33A6NCF5 533 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 H7C1D1 291 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 MEIS1O00470 390 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 PLS3P13797 630 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 GRK2P25098 689 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 LSP1P33241 339 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 GRIK1P39086 918 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 GBX1Q14549 363 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 RALBP1Q15311 655 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 UVSSAQ2YD98 709 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 RASSF3Q86WH2 238 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 TPH2Q8IWU9 490 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 PLVAPQ9BX97 442 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 ATG3Q9NT62 314 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ATP9B-211ENST00000587878 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.08□□□□□ -1.28
ATP9B-211ENST00000587878 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ATP9B-211ENST00000587878 SH3BP5O60239 455 aa7.08□□□□□ -1.28
ATP9B-211ENST00000587878 CBX7O95931 251 aa7.08□□□□□ -1.28
ATP9B-211ENST00000587878 EOMESO95936 686 aa7.08□□□□□ -1.28
ATP9B-211ENST00000587878 MT-CO1P00395 513 aa7.08□□□□□ -1.28
ATP9B-211ENST00000587878 VAV1P15498 845 aa7.08□□□□□ -1.28
ATP9B-211ENST00000587878 HSPA6P17066 643 aa7.08□□□□□ -1.28
ATP9B-211ENST00000587878 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ATP9B-211ENST00000587878 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms