RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568810.5

PPP4C-213, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,080 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-213	ENST00000568810	PRC1	O43663	620 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	CFB	P00751	764 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	HOMER1	Q86YM7	354 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	TMTC2	Q8N394	836 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	TMEM87B	Q96K49	555 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	OPLAH	O14841	1288 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	DDAH1	O94760	285 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	HSD17B4	P51659	736 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	TTLL4	Q14679	1199 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	PIGS	Q96S52	555 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	CYTH3	O43739	400 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	KIF5B	P33176	963 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	ITGA7	Q13683	1181 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	STXBP2	Q15833	593 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	RNF20	Q5VTR2	975 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	CDC45	O75419	566 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	TIMP1	P01033	207 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	FPGS	Q05932	587 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	SHH	Q15465	462 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	GRIN2D	O15399	1336 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	CD4	P01730	458 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	PXMP2	Q9NR77	195 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	CCDC69	A6NI79	296 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	LIFR	P42702	1097 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-213	ENST00000568810		A6NJR5	290 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	SMARCA1	P28370	1054 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	MFSD5	Q6N075	450 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	KPNA6	O60684	536 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	ARIH2	O95376	493 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	NR3C2	P08235	984 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	PSMC6	P62333	389 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	COPS5	Q92905	334 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	MYL10	Q9BUA6	226 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	MYL3	P08590	195 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	CALM1	P0DP23	149 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	CALM2	P0DP24	149 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	CALM3	P0DP25	149 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	GNAQ	P50148	359 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	DEFB123	Q8N688	67 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	POLR2M	P0CAP2	368 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	EPHB4	P54760	987 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	GH1	P01241	217 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	TMEM199	Q8N511	208 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	B4GALT4	O60513	344 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	28.71	■■■□□ 2.19	2e-6	■■□□□ 11.4
PPP4C-213	ENST00000568810	LY6K	Q17RY6	165 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		28.7	■■■□□ 2.19
PPP4C-213	ENST00000568810	ARHGAP1	Q07960	439 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	NEK1	Q96PY6	1258 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	HIPK3	Q9H422	1215 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	PGM5	Q15124	567 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810		Q7L0L9	218 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-213	ENST00000568810	NEFL	P07196	543 aa		28.68	■■■□□ 2.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms