RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZBBXA8MT70 800 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLRF2D3W0D1 207 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 CFBP00751 764 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP21A2P08686 494 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOSL2P15408 326 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 EDNRBP24530 442 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHMLP26374 656 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPT1AP50416 773 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRDNQ13061 729 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEC23AQ15436 765 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNERQ8NFT8 737 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 RMDN3Q96TC7 470 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL23AQ9NPF7 189 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q9Y3F1 56 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTLL4Q14679 1199 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRIN2CQ14957 1233 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 LY6KQ17RY6 165 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 SKAP1Q86WV1 359 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 AFG1LQ8WV93 481 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKS1AQ92625 1134 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 TIFAQ96CG3 184 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIGSQ96S52 555 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PBX4Q9BYU1 374 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 GBF1Q92538 1859 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCN5AQ14524 2016 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERICH2A1L162 156 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 B4DLN1 442 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 E7EWF7 191 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 OPLAHO14841 1288 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 SGSM2O43147 1006 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 GH1P01241 217 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 FGBP02675 491 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 MMP3P08254 477 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF286BP0CG31 522 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 RABGGTBP53611 331 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANTXR2P58335 489 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 WTAPQ15007 396 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP38Q8NB14 1042 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL31RAQ8NI17 732 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPM1EQ8WY54 764 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYL10Q9BUA6 226 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 AMNQ9BXJ7 453 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF576Q9H609 170 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PXMP2Q9NR77 195 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOD1Q9Y239 953 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.34□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-212ENST00000567690 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 A6NJR5 290 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZBTB5O15062 677 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 NR3C2P08235 984 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYOGP15173 224 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 NT5C2P49902 561 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP1Q07960 439 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRM4Q14833 912 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 STXBP2Q15833 593 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASIP1Q5U651 963 aa8.33□□□□□ -1.08
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