RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 MRE11P49959 708 aa23.29■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 TKFCQ3LXA3 575 aa23.29■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 PDILTQ8N807 584 aa23.29■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.29■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.29■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 RAB34Q9BZG1 259 aa23.29■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 RNF146Q9NTX7 359 aa23.29■■□□□ 1.32
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CTU2-208ENST00000566637 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.29■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 ATP2A1O14983 1001 aa23.28■■□□□ 1.32
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CTU2-208ENST00000566637 TXKP42681 527 aa23.28■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 GHRHRQ02643 423 aa23.28■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.322e-12■■□□□ 13.7
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CTU2-208ENST00000566637 PANK2Q9BZ23 570 aa23.28■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.28■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.28■■□□□ 1.32
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CTU2-208ENST00000566637 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.27■■□□□ 1.32
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CTU2-208ENST00000566637 MB21D1Q8N884 522 aa23.27■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 DHX58Q96C10 678 aa23.27■■□□□ 1.32
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CTU2-208ENST00000566637 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CTU2-208ENST00000566637 CIITAP33076 1130 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 UBA7P41226 1012 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
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CTU2-208ENST00000566637 Q4G0T1 1027 aa23.26■■□□□ 1.31
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CTU2-208ENST00000566637 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 OSBPP22059 807 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 TECP42680 631 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 PLS1Q14651 629 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 CHADLQ6NUI6 762 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 IQUBQ8NA54 791 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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CTU2-208ENST00000566637 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.25■■□□□ 1.31
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CTU2-208ENST00000566637 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.23■■□□□ 1.31
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CTU2-208ENST00000566637 RIPK3Q9Y572 518 aa23.23■■□□□ 1.31
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CTU2-208ENST00000566637 PDIA5Q14554 519 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 FAM86B1E9PN63 330 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 CDC25AP30304 524 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 UBXN2AP68543 259 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 MOGSQ13724 837 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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CTU2-208ENST00000566637 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 FAM20AQ96MK3 541 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 DISC1Q9NRI5 854 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 COL20A1Q9P218 1284 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 CETPP11597 493 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 GTF2A2P52657 109 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 HERVK_113P62684 666 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 PNOCQ13519 176 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 CHST13Q8NET6 341 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-208ENST00000566637 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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