RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	STRC	Q7RTU9	1775 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	BLACE	A4D250	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452		B8ZZF3	427 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452		K7ESF4	209 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	LRIG2	O94898	1065 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	ALX3	O95076	343 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SCG5	P05408	212 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	NEFM	P07197	916 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	ADH5	P11766	374 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	IL2	P60568	153 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	NFIA	Q12857	509 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	FAP	Q12884	760 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	NTRK3	Q16288	839 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	CD109	Q6YHK3	1445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	PRR19	A6NJB7	356 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	GAS7	O60861	476 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	CRTAM	O95727	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	ITGB5	P18084	799 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	ETV3	P41162	512 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF445	P59923	1031 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	OCRL	Q01968	901 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	ISL2	Q96A47	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	TNKS	O95271	1327 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452		M0R2C6	588 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	CBX4	O00257	560 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BBS2-215	ENST00000566452	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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