RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 NEK4P51957 841 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF460Q14592 562 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 DHCR24Q15392 516 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 NKPD1Q17RQ9 610 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 CDKAL1Q5VV42 579 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 PKN3Q6P5Z2 889 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 RNF111Q6ZNA4 994 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 TCFL5Q9UL49 500 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 MARCH6O60337 910 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 JMJD7P0C870 316 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 GUCY1A3Q02108 690 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 GAB4Q2WGN9 574 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 AKNAQ7Z591 1439 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 SHISA5Q8N114 240 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 ATL2Q8NHH9 583 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 H3BS24 57 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 KPNA6O60684 536 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 GSTM1P09488 218 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 PLS3P13797 630 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 PAMP19021 973 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 LTKP29376 864 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 CFAP100Q494V2 611 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 RTP2Q5QGT7 225 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 DIO2Q92813 273 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 MMP19Q99542 508 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 ORAI3Q9BRQ5 295 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 ALG1Q9BT22 464 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 CLEC1BQ9P126 229 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 DUSP13Q9UII6 198 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 FMN1Q68DA7 1419 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 POGZQ7Z3K3 1410 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 KIF21BO75037 1637 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 WDR64B1ANS9 1081 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 ARVCFO00192 962 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 BRINP1O60477 761 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 IGLV1-40P01703 118 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 KIF18BQ86Y91 864 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 U3KQE9 123 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 FANCAO15360 1455 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 PTPRMP28827 1452 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 PLCH2O75038 1416 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 EYA4O95677 639 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 STRN3Q13033 797 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 KIZQ2M2Z5 673 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 ODR4Q5SWX8 454 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 LBX2Q6XYB7 198 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC103Q8IW40 242 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 NETO1Q8TDF5 533 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 MTFR1LQ9H019 292 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 FSTP19883 344 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.145e-10■□□□□ 10.1
TMOD3-208ENST00000560725 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 SLC51AQ86UW1 340 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 USP7Q93009 1102 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 UBE2FQ969M7 185 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 WNK4Q96J92 1243 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-208ENST00000560725 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms