RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF165P49910 485 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 INHBCP55103 352 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 CORO7P57737 925 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 LDLRAD1Q5T700 205 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM192Q8IY95 271 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 NAT16Q8N8M0 369 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM87AQ8NBN3 555 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 NKD1Q969G9 470 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 ZG16BQ96DA0 208 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 SYT3Q9BQG1 590 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 C8BP07358 591 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 CYP2C8P10632 490 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 CCNFP41002 786 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 EPHB4P54760 987 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 PRR31Q5SQ13 230 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 Q8TCH9 128 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 SLC6A18Q96N87 628 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 NT5C1AQ9BXI3 368 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.98□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.97□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.97□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 TNFRSF10CO14798 259 aa4.97□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA0825Q8IV33 1275 aa4.97□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 SLC9A7Q96T83 725 aa4.97□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 PTPN18Q99952 460 aa4.97□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 SPON2Q9BUD6 331 aa4.97□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.97□□□□□ -1.61
FAM227B-211ENST00000560557 C9orf118A6NHY6 69 aa4.96□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 GSTM1P09488 218 aa4.96□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 MCM7P33993 719 aa4.96□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP10-11P60412 298 aa4.96□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 KYQ8NBH2 561 aa4.96□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.96□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 BCL11AQ9H165 835 aa4.96□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF76P36508 570 aa4.95□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PPP2CBP62714 309 aa4.95□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PPP2CAP67775 309 aa4.95□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 SLC9A5Q14940 896 aa4.95□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 CYP2R1Q6VVX0 501 aa4.95□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 MBD6Q96DN6 1003 aa4.95□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.95□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 BACH2Q9BYV9 841 aa4.95□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa4.95□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 C9IYK1 514 aa4.94□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 RGS19P49795 217 aa4.94□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF394Q53GI3 561 aa4.94□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 USP48Q86UV5 1035 aa4.94□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.94□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.94□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 ZNRF3Q9ULT6 936 aa4.94□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.94□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 SHOXO15266 292 aa4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 FANCCQ00597 558 aa4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 NRN1LQ496H8 165 aa4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 SLFN13Q68D06 897 aa4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PEX11GQ96HA9 241 aa4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 JADE2Q9NQC1 790 aa4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 FBLN5Q9UBX5 448 aa4.93□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 GSNP06396 782 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PTH1RQ03431 593 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 TMCO4Q5TGY1 634 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 AGAP2Q99490 1192 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 DSCC1Q9BVC3 393 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 CSRNP2Q9H175 543 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.92□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 IMPDH2P12268 514 aa4.91□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 FBXW10Q5XX13 1052 aa4.91□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 DCAF15Q66K64 600 aa4.91□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 PCSK4Q6UW60 755 aa4.91□□□□□ -1.62
FAM227B-211ENST00000560557 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms