RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 STIM2Q9P246 746 aa6.89□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM13AO94988 1023 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 MYBL2P10244 700 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 CFAP157Q5JU67 520 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.89□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 CLTCL1P53675 1640 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 AHCYL1O43865 530 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 KRT2P35908 639 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 STRN3Q13033 797 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 DOK7Q18PE1 504 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 MICU3Q86XE3 530 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SNX21Q969T3 373 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.89□□□□□ -1.31
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