RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 RNF139Q8WU17 664 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM11Q96F44 468 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 ACCSQ96QU6 501 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 ODF2LQ9ULJ1 636 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 FLT1P17948 1338 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 MYL7Q01449 175 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 RAD51Q06609 339 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SDE2Q6IQ49 451 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 BEST2Q8NFU1 509 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 CEP170P1Q96L14 293 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 ANO3Q9BYT9 981 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PPLO60437 1756 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SGSM2O43147 1006 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TRAK2O60296 914 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 GCNT3O95395 438 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 MYL1P05976 194 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 GABPAQ06546 454 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 NR1H3Q13133 447 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF560Q96MR9 790 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 RMDN3Q96TC7 470 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 MOCS3O95396 460 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 LAMC2Q13753 1193 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 RGMBQ6NW40 437 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 NYAP2Q9P242 653 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 AFMP43652 599 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 KCNQ4P56696 695 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SLC27A2O14975 620 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 K7ENM7 598 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PSMD14O00487 310 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 KRT9P35527 623 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 AP3M2P53677 418 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 FSTL1Q12841 308 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PTGDRQ13258 359 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SNX17Q15036 470 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 MTERF2Q49AM1 385 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM51Q9NW97 253 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 STK17AQ9UEE5 414 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PAX3P23760 479 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PTPROQ16827 1216 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC24Q50LG9 513 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 ZMYM6O95789 1325 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 UNCXA6NJT0 531 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 GYS1P13807 737 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PLCB3Q01970 1234 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF174Q15697 407 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 INF2Q27J81 1249 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 CNPY4Q8N129 248 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 FAM20AQ96MK3 541 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 ABL1P00519 1130 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 RAG1P15918 1043 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 CA4P22748 312 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 EFNA5P52803 228 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PPP2R5DQ14738 602 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 GANCQ8TET4 914 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms