RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 PXMP2Q9NR77 195 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MEIS2O14770 477 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ADAMTS3O15072 1205 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 POLR2MP0CAP2 368 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SCG2P13521 617 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 IFNAR1P17181 557 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 NAPAP54920 295 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PDE4DQ08499 809 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ST3GAL1Q11201 340 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TRAF1Q13077 416 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ME3Q16798 604 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TAPT1Q6NXT6 567 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 NECAB1Q8N987 351 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 BACH2Q9BYV9 841 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MYADML2A6NDP7 307 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MSCO60682 206 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PFKFB2O60825 505 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ARIH2O95376 493 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 CTDNEP1O95476 244 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PGK1P00558 417 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 RARBP10826 455 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SMPD1P17405 629 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PGM5Q15124 567 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ANKRD1Q15327 319 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PGBD1Q96JS3 809 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 AIFM3Q96NN9 605 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MAF1Q9H063 256 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 VTA1Q9NP79 307 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 BARHL2Q9NY43 387 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PIK3CDO00329 1044 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 CPLX1O14810 134 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ADAMTS4O75173 837 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 NR3C2P08235 984 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TNFAIP2Q03169 654 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 LRRC41Q15345 812 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 COPS5Q92905 334 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 CUL5Q93034 780 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 GTF3C6Q969F1 213 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TMEM260Q9NX78 707 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SMCO2A6NFE2 343 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 DNM1LO00429 736 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 RGS20O76081 388 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ADCY7P51828 1080 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 RABEP1Q15276 862 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 STXBP2Q15833 593 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TLK2Q86UE8 772 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 IWS1Q96ST2 819 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 C11orf49Q9H6J7 331 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
CS-211ENST00000548041 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms