RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 SCLT1Q96NL6 688 aa11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ISCUQ9H1K1 167 aa11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 HOMER3Q9NSC5 361 aa11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 GDAQ9Y2T3 454 aa11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.95□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ABCA3Q99758 1704 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 MBD4O95243 580 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 SCTRP47872 440 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CARSP49589 748 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CYP27A1Q02318 531 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 PKN1Q16512 942 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 IFT81Q8WYA0 676 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 DENND2AQ9ULE3 1009 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 GLI3P10071 1580 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 NT5C2P49902 561 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 TCIRG1Q13488 830 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ODF2Q5BJF6 829 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 TATDN2Q93075 761 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 HVCN1Q96D96 273 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 PBKQ96KB5 322 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 TLR10Q9BXR5 811 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 SH3GLB2Q9NR46 395 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 RREB1Q92766 1687 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 DOCK2Q92608 1830 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 GSG1L2A8MUP6 293 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ORC4O43929 436 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 RTN2O75298 545 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 GLI1P08151 1106 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 MYBP10242 640 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 UBA7P41226 1012 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 SEC24CP53992 1094 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 NLRP5P59047 1200 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 PPARAQ07869 468 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ITIH4Q14624 930 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 NAA25Q14CX7 972 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 SEC23AQ15436 765 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 MAN2A1Q16706 1144 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 HOOK3Q86VS8 718 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CCDC197Q8NCU1 140 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 TCP11Q8WWU5 503 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 STAMQ92783 540 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CUL5Q93034 780 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 AK8Q96MA6 479 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 MTRQ99707 1265 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 MLXIPQ9HAP2 919 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 MEGF6O75095 1541 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 TRIM49BA6NDI0 452 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 NBPF26B4DH59 902 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 CCDC188H7C350 402 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ZNF263O14978 683 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 ATP6V1G2O95670 118 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 PRPHP41219 470 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 FUT2Q10981 343 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms