RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBM4B-208	ENST00000534198	MCM3AP	O60318	1980 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBM4B-208	ENST00000534198	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	ORC4	O43929	436 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	BAIAP3	O94812	1187 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	ERVK-21	P61565	698 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	DEFB103A	P81534	67 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	RBL2	Q08999	1139 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	BFSP2	Q13515	415 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	VPS53	Q5VIR6	699 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	DCAF4	Q8WV16	495 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	NAPB	Q9H115	298 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TSPY2	A6NKD2	308 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	GJB5	O95377	273 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	CALML3	P27482	149 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	HIC1	Q14526	733 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	ALX1	Q15699	326 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	PTGIS	Q16647	500 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	MIER1	Q8N108	512 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	SCFD2	Q8WU76	684 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	AFG1L	Q8WV93	481 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	RAD9A	Q99638	391 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	MTMR7	Q9Y216	660 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC01553	A4QN01	128 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	SNHG28	P0DPA3	235 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	PDHB	P11177	359 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	SELP	P16109	830 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	ARHGAP1	Q07960	439 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	PPP2R5B	Q15173	497 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	DNER	Q8NFT8	737 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	CAGE1	Q8TC20	777 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	WNT8B	Q93098	351 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	COL20A1	Q9P218	1284 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	POTEB3	A0JP26	581 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	HAS3	O00219	553 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	FGA	P02671	866 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	MMP3	P08254	477 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	CKB	P12277	381 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	IL9	P15248	144 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	PDE4D	Q08499	809 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF543	Q08ER8	600 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	LY6K	Q17RY6	165 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC96	Q2M329	555 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	GJD3	Q8N144	294 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	NEK9	Q8TD19	979 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	GBF1	Q92538	1859 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	MYH8	P13535	1937 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	PRR33	A8MZF0	331 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	COL19A1	Q14993	1142 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TET1	Q8NFU7	2136 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TTC14	Q96N46	770 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM4B-208	ENST00000534198	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms