RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523263.1

VIRMA-208, Transcript of vir like m6A methyltransferase associated, human

TSL 3

Gene VIRMA, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VIRMA-208	ENST00000523263	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	PPP2R5B	Q15173	497 aa		11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	GBF1	Q92538	1859 aa		11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		11.18	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	LCHN	A4D1U4	455 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	NFIB	O00712	420 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	FGR	P09769	529 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	PDE4D	Q08499	809 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	PTGIS	Q16647	500 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	SPRED2	Q7Z698	418 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	NAPB	Q9H115	298 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	NOD1	Q9Y239	953 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	MCM3AP	O60318	1980 aa		11.17	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	SNAP25	P60880	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	BCL11A	Q9H165	835 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		11.16	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	ORC4	O43929	436 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	NBN	O60934	754 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	DEFB103A	P81534	67 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	IKBKE	Q14164	716 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	KAT2B	Q92831	832 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	SAMD11	Q96NU1	681 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		11.15	□□□□□ -0.62
VIRMA-208	ENST00000523263	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	CKB	P12277	381 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	CALML3	P27482	149 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MRE11	P49959	708 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PTK7	Q13308	1070 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	COPS5	Q92905	334 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PIEZO1	Q92508	2521 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MYH4	Q9Y623	1939 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	HAS3	O00219	553 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	FOXP2	O15409	715 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	DCX	O43602	365 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	NMT2	O60551	498 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	ARIH2	O95376	493 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	GH1	P01241	217 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MMP3	P08254	477 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	SNHG28	P0DPA3	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	IL9	P15248	144 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	KCNA5	P22460	613 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	SLC16A2	P36021	539 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	NHLH1	Q02575	133 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	ARHGAP1	Q07960	439 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	ALX1	Q15699	326 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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