RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 RXRAP19793 462 aa28.63■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 PSMC6P62333 389 aa28.63■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.63■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa28.63■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP2R5BQ15173 497 aa28.62■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.62■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM126BQ8IXS8 530 aa28.62■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.62■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 SCFD2Q8WU76 684 aa28.62■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAF1Q9H063 256 aa28.62■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 TBX21Q9UL17 535 aa28.62■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 DDAH1O94760 285 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 TXNP10599 105 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 RAG1P15918 1043 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 EPHB4P54760 987 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 GHRHRQ02643 423 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 SHHQ15465 462 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 SEPT14Q6ZU15 432 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 RASEFQ8IZ41 740 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC43A3Q8NBI5 491 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM87BQ96K49 555 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 MTA3Q9BTC8 594 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 PXMP2Q9NR77 195 aa28.61■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa28.6■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 B4DLN1 442 aa28.6■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZEB2O60315 1214 aa28.6■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLEKHA8P1O95397 391 aa28.6■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 ITGA7Q13683 1181 aa28.6■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGEF16Q5VV41 709 aa28.6■■■□□ 2.17
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LAPTM4B-202ENST00000517924 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.6■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.6■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 CABYRO75952 493 aa28.59■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.59■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC62Q6P9F0 684 aa28.59■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 IWS1Q96ST2 819 aa28.59■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAP3K14Q99558 947 aa28.59■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa28.59■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC69A6NI79 296 aa28.58■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 CD4P01730 458 aa28.58■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 NR3C2P08235 984 aa28.58■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 LY6KQ17RY6 165 aa28.58■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 IL31RAQ8NI17 732 aa28.58■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa28.58■■■□□ 2.17
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYL3P08590 195 aa28.57■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 LIFRP42702 1097 aa28.57■■■□□ 2.16
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LAPTM4B-202ENST00000517924 TTLL4Q14679 1199 aa28.57■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 STXBP2Q15833 593 aa28.57■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 RNF20Q5VTR2 975 aa28.57■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.57■■■□□ 2.16
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CPT1AP50416 773 aa28.56■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 Q7L0L9 218 aa28.56■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMTC2Q8N394 836 aa28.56■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
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LAPTM4B-202ENST00000517924 PDCD2LQ9BRP1 358 aa28.56■■■□□ 2.16
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LAPTM4B-202ENST00000517924 FCHSD1Q86WN1 690 aa28.55■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa28.55■■■□□ 2.16
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LAPTM4B-202ENST00000517924 RGS20O76081 388 aa28.54■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 POLR2MP0CAP2 368 aa28.54■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
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LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC12A7Q9Y666 1083 aa28.54■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 UMODL1Q5DID0 1318 aa28.53■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa28.53■■■□□ 2.16
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LAPTM4B-202ENST00000517924 NEFLP07196 543 aa28.53■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGAP1Q07960 439 aa28.53■■■□□ 2.16
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LAPTM4B-202ENST00000517924 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.53■■■□□ 2.16
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LAPTM4B-202ENST00000517924 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CYP2C18P33260 490 aa28.52■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 SGMS1Q86VZ5 419 aa28.52■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 MICU3Q86XE3 530 aa28.52■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC82Q8N4S0 544 aa28.52■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
LAPTM4B-202ENST00000517924 CALM1P0DP23 149 aa28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 CALM2P0DP24 149 aa28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 CALM3P0DP25 149 aa28.51■■■□□ 2.15
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