RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515629.5

SLC38A9-223, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2 BASIC

Gene SLC38A9, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-223	ENST00000515629	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	UROC1	Q96N76	676 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	LTN1	O94822	1766 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	ESPN	B1AK53	854 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	GRK2	P25098	689 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	PRPH	P41219	470 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	GJA9	P57773	515 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	CCNG2	Q16589	344 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	IP6K1	Q92551	441 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	STIM2	Q9P246	746 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629		A0A1W2PP64	1363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	RASA4B	C9J798	803 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	DDAH1	O94760	285 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	MICAL2	O94851	1124 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	MUT	P22033	750 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	GART	P22102	1010 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	FBLN1	P23142	703 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	CRK	P46108	304 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	NRL	P54845	237 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	USP46	P62068	366 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	GBX1	Q14549	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	GJD3	Q8N144	294 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	MYD88	Q99836	296 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629		A6NHS1	94 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	EYA2	O00167	538 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	NCAM2	O15394	837 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	GPR39	O43194	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	AHCYL1	O43865	530 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	NUDT7	P0C024	238 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	PDE6C	P51160	858 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	AK2	P54819	239 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	GABRE	P78334	506 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	COX10	Q12887	443 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	HAUS7	Q99871	368 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	AAAS	Q9NRG9	546 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	NSD2	O96028	1365 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	STXBP3	O00186	592 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	TLR5	O60602	858 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLC38A9-223	ENST00000515629	DNTT	P04053	509 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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