RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 VWA3BQ502W6 1294 aa7.32□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 CXorf38Q8TB03 319 aa7.32□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.32□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.32□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 FUCA1P04066 466 aa7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 SLURP1P55000 103 aa7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 SLC9A5Q14940 896 aa7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 COPS5Q92905 334 aa7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 CAPN10Q9HC96 672 aa7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 A0A1B0GTL3 188 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 HTRA3P83110 453 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 MBLAC2Q68D91 279 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 LIPIQ6XZB0 460 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 TEPSINQ96N21 525 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 LGR4Q9BXB1 951 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.3□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 ZBTB7AO95365 584 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 NTRK1P04629 796 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 THBDP07204 575 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 MMP19Q99542 508 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 SPATA25Q9BR10 227 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 BTG4Q9NY30 223 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.29□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.28□□□□□ -1.24
RUFY3-215ENST00000515479 CELA3BP08861 270 aa7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 VPS37DQ86XT2 251 aa7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 USP40Q9NVE5 1235 aa7.27□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 SH3D21A4FU49 640 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 B2RBV5 119 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 INF2Q27J81 1249 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 TNNI3KQ59H18 835 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 FRS2Q8WU20 508 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 DPF3Q92784 378 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 NOX5Q96PH1 765 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.26□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 C22orf46C9J442 243 aa7.25□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 SV2CQ496J9 727 aa7.25□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.25□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.25□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 CARFQ8N187 725 aa7.25□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.25□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 DDX11Q96FC9 970 aa7.25□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.25□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.25□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 TBX1O43435 398 aa7.24□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 DDAH1O94760 285 aa7.24□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 ITGAVP06756 1048 aa7.24□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 CYP2C8P10632 490 aa7.24□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.24□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.24□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 BDH2Q9BUT1 245 aa7.24□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 NTMQ9P121 344 aa7.24□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 SUSD5O60279 629 aa7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 C8BP07358 591 aa7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 FPR2P25090 351 aa7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 ECI1P42126 302 aa7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 CYP4F3Q08477 520 aa7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 RTP5Q14D33 572 aa7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 UBXN11Q5T124 520 aa7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 IQCEQ6IPM2 695 aa7.23□□□□□ -1.25
RUFY3-215ENST00000515479 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms