RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TMTC2Q8N394 836 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 SZT2Q5T011 3432 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 CALM1P0DP23 149 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 CALM2P0DP24 149 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 CALM3P0DP25 149 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 FANCBQ8NB91 859 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 GDF15Q99988 308 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 APOBRQ0VD83 1088 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP2R5BQ15173 497 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZUG5 572 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SPC25Q9HBM1 224 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB43O43298 467 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TLE2Q04725 743 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 USP26Q9BXU7 913 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MAF1Q9H063 256 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS6KB1P23443 525 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SMARCA1P28370 1054 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC27P30260 824 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GNAQP50148 359 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FUT2Q10981 343 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PGM5Q15124 567 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RTN1Q16799 776 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SCFD2Q8WU76 684 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 BRF1Q92994 677 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS20O76081 388 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 NR3C2P08235 984 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR2MP0CAP2 368 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGB8P26012 769 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMC6P62333 389 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SCN5AQ14524 2016 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 NID2Q14112 1375 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 LY6KQ17RY6 165 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IWS1Q96ST2 819 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 Q9Y3F1 56 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GRIN2DO15399 1336 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ELP1O95163 1332 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CLTBP09497 229 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FGD1P98174 961 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL4Q14679 1199 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 STXBP2Q15833 593 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 B4DLN1 442 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MEIS2O14770 477 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP1Q07960 439 aa21.58■■□□□ 1.05
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