RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CPP00450 1065 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 CAPNS1P04632 268 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 DIO2Q92813 273 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 C1orf159Q96HA4 380 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 IER2Q9BTL4 223 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-215ENST00000506510 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 NTRK1P04629 796 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 FPR2P25090 351 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 KCNAB2Q13303 367 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 IQCEQ6IPM2 695 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 NETO2Q8NC67 525 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 PANK1Q8TE04 598 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC140Q96MF4 163 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 RFXAPO00287 272 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 LCP1P13796 627 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 NLRP10Q86W26 655 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 BTBD11A6QL63 1104 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 C22orf46C9J442 243 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 MYO1BO43795 1136 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 FBLN1P23142 703 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 BCL6P41182 706 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 MAP4K2Q12851 820 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF385BQ569K4 471 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 SPATC1Q76KD6 591 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 ALG3Q92685 438 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 PEX11GQ96HA9 241 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 SGSM3Q96HU1 749 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 PDPK1O15530 556 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 DLX3O60479 287 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 LTBRP36941 435 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 MC3RP41968 323 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 LIMS1P48059 325 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 TESK1Q15569 626 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 NBPF4Q96M43 638 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 PRODHO43272 600 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 PFKLP17858 780 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 PMLP29590 882 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 USP53Q70EK8 1073 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 CEP68Q76N32 757 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 FAM129CQ86XR2 697 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 ASGR2P07307 311 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 ATF2P15336 505 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 GTF2A2P52657 109 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 MTERF2Q49AM1 385 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 Q8N1Y9 231 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 ARMC5Q96C12 935 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM169Q96HH4 297 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-215ENST00000506510 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 FGFR1P11362 822 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SERINC3Q13530 473 aa7.21□□□□□ -1.26
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