RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496332.5

THBS3-208, Transcript of thrombospondin 3, human

TSL 3

Gene THBS3, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THBS3-208	ENST00000496332	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	DDAH1	O94760	285 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	NEFL	P07196	543 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	RAG1	P15918	1043 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	ITGB8	P26012	769 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	HSD17B4	P51659	736 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	TRAF1	Q13077	416 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.73	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	KIF5B	P33176	963 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	LIFR	P42702	1097 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	CPT1A	P50416	773 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	GHRHR	Q02643	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	STXBP2	Q15833	593 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	COPS5	Q92905	334 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	ARIH2	O95376	493 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	NR3C2	P08235	984 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	MYL3	P08590	195 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	RXRA	P19793	462 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	PSMC6	P62333	389 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	SHH	Q15465	462 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.71	□□□□□ -0.21
THBS3-208	ENST00000496332	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.71	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332		A6NJR5	290 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	TIMP1	P01033	207 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	CD4	P01730	458 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	CALM1	P0DP23	149 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	CALM2	P0DP24	149 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	CALM3	P0DP25	149 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	GNAQ	P50148	359 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.7	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	EPHB4	P54760	987 aa		13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	FPGS	Q05932	587 aa		13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.69	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	KPNA6	O60684	536 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	GH1	P01241	217 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	KRT32	Q14532	448 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	PGM5	Q15124	567 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
THBS3-208	ENST00000496332	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22

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