RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 CD4P01730 458 aa22.54■■□□□ 1.2
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USP40-217ENST00000496298 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.54■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.54■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.54■■□□□ 1.2
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USP40-217ENST00000496298 Q7L0L9 218 aa22.44■■□□□ 1.18
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USP40-217ENST00000496298 TMEM199Q8N511 208 aa22.44■■□□□ 1.18
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USP40-217ENST00000496298 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 NEK1Q96PY6 1258 aa22.44■■□□□ 1.18
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USP40-217ENST00000496298 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.43■■□□□ 1.18
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