RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496277.5

CNIH3-211, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene CNIH3, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-211ENST00000496277 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 GFRA1P56159 465 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 NETO2Q8NC67 525 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 USP33Q8TEY7 942 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 BTG4Q9NY30 223 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 A0A1W2PQU0 124 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 CAPNS1P04632 268 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 GRIA2P42262 883 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 KCNJ6P48051 423 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 PPP2R2AP63151 447 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 RAB33AQ14088 237 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 FBLN7Q53RD9 439 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 FAM129CQ86XR2 697 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 C1orf159Q96HA4 380 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 AGRPO00253 132 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 CPP00450 1065 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 NTRK1P04629 796 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 FPR2P25090 351 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 LIMS1P48059 325 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 KCNAB2Q13303 367 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 NLRP10Q86W26 655 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 ALG3Q92685 438 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 DIO2Q92813 273 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 PEX11GQ96HA9 241 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.29□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 ASGR2P07307 311 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 ATF2P15336 505 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 PFKLP17858 780 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 PMLP29590 882 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 MC3RP41968 323 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 IQCEQ6IPM2 695 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 CCDC140Q96MF4 163 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 C8orf37Q96NL8 207 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.28□□□□□ -1.4
CNIH3-211ENST00000496277 C22orf46C9J442 243 aa6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 LCP1P13796 627 aa6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 TESK1Q15569 626 aa6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 IER2Q9BTL4 223 aa6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 RNF38Q9H0F5 515 aa6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 LTBRP36941 435 aa6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 BCL6P41182 706 aa6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 MAP4K2Q12851 820 aa6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 VMACQ2NL98 169 aa6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 LCE4AQ5TA78 99 aa6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 Q8N1Y9 231 aa6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 PWWP2AQ96N64 755 aa6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.26□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 MYO1BO43795 1136 aa6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 DLX3O60479 287 aa6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 NCAM1P13591 858 aa6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 ATP2B1P20020 1258 aa6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 SLC9A5Q14940 896 aa6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 CEP68Q76N32 757 aa6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 SGSM3Q96HU1 749 aa6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.25□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 TRIM13O60858 407 aa6.24□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 ZBTB7AO95365 584 aa6.24□□□□□ -1.41
CNIH3-211ENST00000496277 INHBBP09529 407 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms