RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 APBA2Q99767 749 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 SPATA25Q9BR10 227 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 NTRK1P04629 796 aa7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 THBDP07204 575 aa7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 CELA3BP08861 270 aa7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 TEPSINQ96N21 525 aa7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 NOX5Q96PH1 765 aa7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.3□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 INF2Q27J81 1249 aa7.3□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.3□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.3□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.3□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 MMP19Q99542 508 aa7.3□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.3□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.3□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.3□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 SH3D21A4FU49 640 aa7.29□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 B2RBV5 119 aa7.29□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 TBX1O43435 398 aa7.29□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 KRTAP10-2P60368 255 aa7.29□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 NCAPHQ15003 741 aa7.29□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.29□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 SLC9A5Q14940 896 aa7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 FRS2Q8WU20 508 aa7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 SYT3Q9BQG1 590 aa7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 BTG4Q9NY30 223 aa7.28□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 ZBTB7AO95365 584 aa7.27□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 C8BP07358 591 aa7.27□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 NAT2P11245 290 aa7.27□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 RTP5Q14D33 572 aa7.27□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.27□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 DDX11Q96FC9 970 aa7.27□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.27□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 JAG2Q9Y219 1238 aa7.27□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 ARNTLO00327 626 aa7.26□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.26□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 CCDC103Q8IW40 242 aa7.26□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 CARFQ8N187 725 aa7.26□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.26□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 SGSM2O43147 1006 aa7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 ITGAVP06756 1048 aa7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 FPR2P25090 351 aa7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 FERMT3Q86UX7 667 aa7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 BDH2Q9BUT1 245 aa7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 CAPN10Q9HC96 672 aa7.25□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 C22orf46C9J442 243 aa7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 NFKB2Q00653 900 aa7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 NLRP10Q86W26 655 aa7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 USP40Q9NVE5 1235 aa7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.24□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 SUSD5O60279 629 aa7.23□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 ETFBP38117 255 aa7.23□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 ECI1P42126 302 aa7.23□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 PLP2Q04941 152 aa7.23□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.23□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 SV2CQ496J9 727 aa7.23□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.23□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 NOBOXO60393 691 aa7.22□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 CYP2C8P10632 490 aa7.22□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.22□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.22□□□□□ -1.25
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