RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.79□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 COPS5Q92905 334 aa5.79□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 USP40Q9NVE5 1235 aa5.79□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.79□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa5.79□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.79□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 A0A1B0GTL3 188 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 FUCA1P04066 466 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 SCRN1Q12765 414 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 NCAPHQ15003 741 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 MMP19Q99542 508 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 SPATA25Q9BR10 227 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 CLEC1BQ9P126 229 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFCD-210ENST00000490205 NTRK1P04629 796 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 PLS3P13797 630 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 PLP2Q04941 152 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 RTP5Q14D33 572 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 UBXN11Q5T124 520 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 CARFQ8N187 725 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 BDH2Q9BUT1 245 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 CYP26B1Q9NR63 512 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 THBDP07204 575 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 MBLAC2Q68D91 279 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 IQCEQ6IPM2 695 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 NOX5Q96PH1 765 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 NTMQ9P121 344 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 CYP2C8P10632 490 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 SPATS1Q496A3 300 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 DPF3Q92784 378 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 DDX11Q96FC9 970 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 BTG4Q9NY30 223 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 C22orf46C9J442 243 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 ADRB1P08588 477 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 GJA9P57773 515 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 INF2Q27J81 1249 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 VPS37DQ86XT2 251 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 SEC14L1Q92503 715 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 BORCS6Q96GS4 357 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 CAPN10Q9HC96 672 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 SGSM2O43147 1006 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 NOBOXO60393 691 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 HOXC12P31275 282 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 EFEMP1Q12805 493 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 TNNI3KQ59H18 835 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 FERMT3Q86UX7 667 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 NPLOC4Q8TAT6 608 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 FRS2Q8WU20 508 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
NELFCD-210ENST00000490205 C8BP07358 591 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 SLC6A11P48066 632 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 GTF2A2P52657 109 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 NFKB2Q00653 900 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 SV2CQ496J9 727 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 MROH9Q5TGP6 573 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms