RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 IL17AQ16552 155 aa10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 KRBA2Q6ZNG9 492 aa10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 VSTM4Q8IW00 320 aa10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 CNNM3Q8NE01 707 aa10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 CRYGNQ8WXF5 182 aa10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 FERMT2Q96AC1 680 aa10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 C12orf42Q96LP6 360 aa10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 DNAI1Q9UI46 699 aa10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa10.82□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 MEIS2O14770 477 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 BACE1P56817 501 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 MAP3K9P80192 1104 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PTGDRQ13258 359 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 INF2Q27J81 1249 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 DLK2Q6UY11 383 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 FBXO11Q86XK2 927 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF280CQ8ND82 737 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 WRNIP1Q96S55 665 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PSTPIP2Q9H939 334 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM260Q9NX78 707 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 KCNH3Q9ULD8 1083 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa10.81□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 MYH4Q9Y623 1939 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 C19orf81C9J6K1 198 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PIK3CDO00329 1044 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 BIN1O00499 593 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ATP8B1O43520 1251 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ATP2B1P20020 1258 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PRPHP41219 470 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 USP14P54578 494 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 SNAP25P60880 206 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 GHRHRQ02643 423 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 TRAF1Q13077 416 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 SPP2Q13103 211 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ELF2Q15723 593 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 MCTP2Q6DN12 878 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 MNS1Q8NEH6 495 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 CUL5Q93034 780 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 MBOAT7Q96N66 472 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 CSRNP2Q9H175 543 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 TMX1Q9H3N1 280 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 AS3MTQ9HBK9 375 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10.8□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.686e-6■□□□□ 10.6
POLR1A-208ENST00000486964 MYH6P13533 1939 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ADM5C9JUS6 153 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 LAD1O00515 517 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 RAD21O60216 631 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 STX10O60499 249 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 CYP3A7P24462 503 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 TUBB4BP68371 445 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 KMT5BQ4FZB7 885 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 NT5DC1Q5TFE4 455 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PPP4R3AQ6IN85 833 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 SYT10Q6XYQ8 523 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 USP49Q70CQ1 688 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 NEK8Q86SG6 692 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 SULF1Q8IWU6 871 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 TBCKQ8TEA7 893 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 SMARCE1Q969G3 411 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 MTMR9Q96QG7 549 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM60Q9H2L4 133 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 PICK1Q9NRD5 415 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 FBXO28Q9NVF7 368 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 FZD1Q9UP38 647 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF536O15090 1300 aa10.79□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC66A2RUB6 948 aa10.78□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 IQCA1LA6NCM1 817 aa10.78□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 EFCAB8A8MWE9 144 aa10.78□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 FDX1P10109 184 aa10.78□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 MCM7P33993 719 aa10.78□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 LONP1P36776 959 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 USP11P51784 963 aa10.78□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 AP3B2Q13367 1082 aa10.78□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 TUBB2AQ13885 445 aa10.78□□□□□ -0.68
POLR1A-208ENST00000486964 POSTNQ15063 836 aa10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms