RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 EFEMP2O95967 443 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 GSTM1P09488 218 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ITGA4P13612 1032 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 SOX9P48436 509 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 BRF1Q92994 677 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 CD320Q9NPF0 282 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PEX10O60683 326 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CD247P20963 164 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 IDI1Q13907 227 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 FIBCD1Q8N539 461 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 C3P01024 1663 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 UNCXA6NJT0 531 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PNLIPP16233 465 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SDHBP21912 280 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ARL4AP40617 200 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CTSWP56202 376 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF445P59923 1031 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 TCEAL1Q15170 157 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 GNPTABQ3T906 1256 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 NUP43Q8NFH3 380 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SYNMO15061 1565 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CLTCL1P53675 1640 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PTPRTO14522 1441 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 NOS1P29475 1434 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ERVK-7P63135 1459 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PQ27 194 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PQ64 194 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PQC6 194 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PQD8 194 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PQY0 241 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 NUAK1O60285 661 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PRKCAP17252 672 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 GJA8P48165 433 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00310P59036 64 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 DLG4P78352 724 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 KIR3DS1Q14943 382 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2R5EQ16537 467 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 RTP2Q5QGT7 225 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 GBP3Q9H0R5 595 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 TNRQ92752 1358 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PTPRMP28827 1452 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CD3EP07766 207 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 INHBBP09529 407 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 GIPRP48546 466 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2R5DQ14738 602 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 JAMLQ86YT9 394 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 HAUS7Q99871 368 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SGPP1Q9BX95 441 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 TONSLQ96HA7 1378 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 MROH2AA6NES4 1674 aa6.68□□□□□ -1.34
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