RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.54■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 CLIC4Q9Y696 253 aa29.54■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 NASPP49321 788 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 ANO1Q5XXA6 986 aa29.53■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 RIOX2Q8IUF8 465 aa29.53■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 GABRQQ9UN88 632 aa29.53■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 GOLGA6L22H0YM25 854 aa29.52■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 GNRH1P01148 92 aa29.52■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 HSD17B4P51659 736 aa29.52■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 Q3C1V9 767 aa29.52■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 TMEM87AQ8NBN3 555 aa29.52■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 ANO3Q9BYT9 981 aa29.52■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa29.52■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 WNT7AO00755 349 aa29.51■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 FOSP01100 380 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 ATP2B1P20020 1258 aa29.51■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 PRKCZQ05513 592 aa29.51■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 SAMD3Q8N6K7 520 aa29.51■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 TBCKQ8TEA7 893 aa29.51■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 SPATA32Q96LK8 384 aa29.51■■■□□ 2.32
SOBP-202ENST00000477448 SPDYE3A6NKU9 549 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 TTC38Q5R3I4 469 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 SH3TC2Q8TF17 1288 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 ACAD9Q9H845 621 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 RCOR1Q9UKL0 485 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 LCTP09848 1927 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 MGAMO43451 1857 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 YEATS4O95619 227 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 HOXD10P28358 340 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 LINC00301Q8NCQ3 95 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 CHST13Q8NET6 341 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.5■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 DDX11L8A8MPP1 907 aa29.49■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa29.49■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 NEK8Q86SG6 692 aa29.49■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 ELP1O95163 1332 aa29.49■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 ERVK-9P63128 1117 aa29.48■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 ERVK-24P63145 666 aa29.48■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 PTPAQ15257 358 aa29.48■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.48■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.48■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 EDIL3O43854 480 aa29.47■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 RPS6P62753 249 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 STK38Q15208 465 aa29.47■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.47■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa29.47■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 RAET1EQ8TD07 263 aa29.47■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 ARMC5Q96C12 935 aa29.47■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 MAF1Q9H063 256 aa29.47■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 LMBRD1Q9NUN5 540 aa29.47■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 BRCA2P51587 3418 aa29.47■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 SLC25A27O95847 323 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 COPB2P35606 906 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 FLT3LGP49771 235 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 PRMT2P55345 433 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 SLC39A14Q15043 492 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 NSMFQ6X4W1 530 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 SLC30A10Q6XR72 485 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 CRYGNQ8WXF5 182 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 COL20A1Q9P218 1284 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 FBXO40Q9UH90 709 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 DOCK3Q8IZD9 2030 aa29.46■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 SREBF1P36956 1147 aa29.45■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 ZNF174Q15697 407 aa29.45■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 LETM2Q2VYF4 491 aa29.45■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 NCAPG2Q86XI2 1143 aa29.45■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 CEP131Q9UPN4 1083 aa29.45■■■□□ 2.31
SOBP-202ENST00000477448 KCNG4Q8TDN1 519 aa29.45■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 ZNF333Q96JL9 665 aa29.45■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 PLXNB2O15031 1838 aa29.44■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 SPTLC2O15270 562 aa29.44■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 ERCC3P19447 782 aa29.44■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 PORCNQ9H237 461 aa29.44■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 BMP15O95972 392 aa29.43■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 MCM7P33993 719 aa29.43■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 RGS19P49795 217 aa29.43■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 ARHGAP4P98171 946 aa29.43■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 SHCBP1Q8NEM2 672 aa29.43■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 EHMT1Q9H9B1 1298 aa29.43■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 CYP39A1Q9NYL5 469 aa29.43■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 PPP6R2O75170 966 aa29.42■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 USP11P51784 963 aa29.42■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SOBP-202ENST00000477448 RPTORQ8N122 1335 aa29.41■■■□□ 2.3
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