RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 TMC1Q8TDI8 760 aa3.39□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 LMF1Q96S06 567 aa3.39□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 KLHL3Q9UH77 587 aa3.39□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 ZDHHC9Q9Y397 364 aa3.39□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 GCP02774 474 aa3.38□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 GSTM1P09488 218 aa3.38□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 NFATC3Q12968 1075 aa3.38□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 ADAM9Q13443 819 aa3.38□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.38□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 DMRTB1Q96MA1 342 aa3.38□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 LRRC37BQ96QE4 947 aa3.38□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 RGS13O14921 159 aa3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 UBOX5O94941 541 aa3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 TAX1BP1Q86VP1 789 aa3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 SALL3Q9BXA9 1300 aa3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 ZAR1LA6NP61 321 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 RHOBTB3O94955 611 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 KRT10P13645 584 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 L1CAMP32004 1257 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 SLC12A9Q9BXP2 914 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 OSBPL7Q9BZF2 842 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 GFOD1Q9NXC2 390 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 GJA4P35212 333 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 AGMOQ6ZNB7 445 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 MIB1Q86YT6 1006 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF366Q8N895 744 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 FAM89AQ96GI7 184 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 EGFL7Q9UHF1 273 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 ADAM29Q9UKF5 820 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 RAD17O75943 681 aa3.34□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 GSNP06396 782 aa3.34□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 CEP72Q9P209 647 aa3.34□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 FTSJ1Q9UET6 329 aa3.34□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 PRR36Q9H6K5 1346 aa3.34□□□□□ -1.87
SHQ1-204ENST00000468347 H3BRB1 525 aa3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 DNAJA2O60884 412 aa3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 POLNQ7Z5Q5 900 aa3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 GLYCTKQ8IVS8 523 aa3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 LZTR1Q8N653 840 aa3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa3.32□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 SIT1Q9Y3P8 196 aa3.32□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa3.32□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 TBC1D8O95759 1140 aa3.31□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 PEX11BO96011 259 aa3.31□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 STRIP1Q5VSL9 837 aa3.31□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 WWC2Q6AWC2 1192 aa3.31□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 PTCHD1Q96NR3 888 aa3.31□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 RWDD3Q9Y3V2 267 aa3.31□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 CYP7B1O75881 506 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 RGS22Q8NE09 1264 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 ZSWIM3Q96MP5 696 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 NELL2Q99435 816 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 PRR13Q9NZ81 148 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 RNF7Q9UBF6 113 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 COX11Q9Y6N1 276 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 GIPC1O14908 333 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 HTR3BO95264 441 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 PBXIP1Q96AQ6 731 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 MTA3Q9BTC8 594 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 LIG3P49916 1009 aa3.28□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 CR1LQ2VPA4 569 aa3.28□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 CLIC6Q96NY7 704 aa3.28□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 RBCK1Q9BYM8 510 aa3.28□□□□□ -1.88
SHQ1-204ENST00000468347 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms