RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 IRAK3Q9Y616 596 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 CAPNS1P04632 268 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 HOXC12P31275 282 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP2R2AP63151 447 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 RAB33AQ14088 237 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 USP33Q8TEY7 942 aa6.51□□□□□ -1.37
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RABGGTB-206ENST00000467748 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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RABGGTB-206ENST00000467748 VMACQ2NL98 169 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 C1orf159Q96HA4 380 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 SCG5P05408 212 aa6.49□□□□□ -1.37
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RABGGTB-206ENST00000467748 FPR2P25090 351 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 MC3RP41968 323 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 NLRP10Q86W26 655 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 BCL6P41182 706 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF385BQ569K4 471 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 CABP7Q86V35 215 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM129CQ86XR2 697 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGGTB-206ENST00000467748 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 ALG3Q92685 438 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 DIO2Q92813 273 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 IER2Q9BTL4 223 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 C22orf46C9J442 243 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 ASGR2P07307 311 aa6.47□□□□□ -1.37
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RABGGTB-206ENST00000467748 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 PMLP29590 882 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.47□□□□□ -1.37
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RABGGTB-206ENST00000467748 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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RABGGTB-206ENST00000467748 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAMTS20P59510 1910 aa6.46□□□□□ -1.38
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RABGGTB-206ENST00000467748 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 PEX11GQ96HA9 241 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGGTB-206ENST00000467748 BLACEA4D250 179 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 SGSM2O43147 1006 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 PRODHO43272 600 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 MSCO60682 206 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 PFKLP17858 780 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 LTBRP36941 435 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 USP53Q70EK8 1073 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM169Q96HH4 297 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-206ENST00000467748 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.44□□□□□ -1.38
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