RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 MYPNQ86TC9 1320 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 NID2Q14112 1375 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR20EP86478 221 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR20CP86479 221 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR20DP86480 221 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR20BP86481 221 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR20AP86496 221 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP2R5BQ15173 497 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 C17orf99Q6UX52 265 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 LBX2Q6XYB7 198 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 HOMER1Q86YM7 354 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 JMYQ8N9B5 988 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 REPS2Q8NFH8 660 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 TMX3Q96JJ7 454 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PIGSQ96S52 555 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CPLX1O14810 134 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 GDF9O60383 454 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CTDNEP1O95476 244 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 BCRP11274 1271 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 SMARCA1P28370 1054 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 STAT3P40763 770 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 MCM2P49736 904 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 ERVK-9P63128 1117 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 ERVK-24P63145 666 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 NTRK3Q16288 839 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 DESI1Q6ICB0 168 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 MB21D1Q8N884 522 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 IL27Q8NEV9 243 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PHKBQ93100 1093 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 GTF3C6Q969F1 213 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 MTMR8Q96EF0 704 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF536O15090 1300 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PLXNB2O15031 1838 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR25O00155 361 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB5O15062 677 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 IFNAR1P17181 557 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 USH1GQ495M9 461 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXO11Q86XK2 927 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 SNX21Q969T3 373 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 RIPK3Q9Y572 518 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 FOXN1O15353 648 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 JAK2O60674 1132 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 ICAM1P05362 532 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 ALAS1P13196 640 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM32Q13049 653 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PKN1Q16512 942 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 PTPRNQ16849 979 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR78Q5VTH9 848 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 HSCBQ8IWL3 235 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 COA7Q96BR5 231 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 DDX11Q96FC9 970 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD28-208ENST00000463533 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms