RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 OPLAHO14841 1288 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CABYRO75952 493 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CALML3P27482 149 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEC23AQ15436 765 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 USH1GQ495M9 461 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP38Q8NB14 1042 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ESR2Q92731 530 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PBX4Q9BYU1 374 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL23AQ9NPF7 189 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYO7AQ13402 2215 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNKSO95271 1327 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNERQ8NFT8 737 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 HERVK_113Q902F9 699 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIPK3Q9H422 1215 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.91□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 A6NJR5 290 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCL23P55773 120 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 GHRHRQ02643 423 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTC22Q5TAA0 569 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM199Q8N511 208 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGS22Q8NE09 1264 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTMR8Q96EF0 704 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCLYQ96I15 445 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF576Q9H609 170 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 SENP2Q9HC62 589 aa9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCB11O95342 1321 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYL3P08590 195 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP2C9P11712 490 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOSL2P15408 326 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 NT5C2P49902 561 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTH1RQ03431 593 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGAP1Q07960 439 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDE4DQ08499 809 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRE1Q14246 886 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP2R5BQ15173 497 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQCA1Q86XH1 822 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCFD2Q8WU76 684 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIFAQ96CG3 184 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNMA2Q9UL42 364 aa9.89□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIP1O00291 1037 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZEB2O60315 1214 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGS20O76081 388 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP21A2P08686 494 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPT1AP50416 773 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 KAT2BQ92831 832 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAF1Q9H063 256 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 KAT14Q9H8E8 782 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTC3P53804 2025 aa9.88□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAD50Q92878 1312 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYTH3O43739 400 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGBP02675 491 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 MMP3P08254 477 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYOGP15173 224 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms