RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP17L3A6NCW0 530 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP17L4A6NCW7 530 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC155Q8N6L0 562 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MTMR8Q96EF0 704 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IL17RBQ9NRM6 502 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CYTH3O43739 400 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 INPP5BP32019 993 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FIGNQ5HY92 759 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EMBQ6PCB8 327 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BTG4Q9NY30 223 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NFU1Q9UMS0 254 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM153BP0C7A2 387 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GUCY2FP51841 1108 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM153CQ494X1 144 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DYMQ7RTS9 669 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TLR10Q9BXR5 811 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM153AQ9UHL3 310 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GLI1P08151 1106 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OR52Z1P0C646 297 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC1A4P43007 532 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NNTQ13423 1086 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A0A1B0GUL6 1792 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TAF1P21675 1872 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CAMTA2O94983 1202 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 APBA1Q02410 837 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C7orf25Q9BPX7 421 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EPB41L5Q9HCM4 733 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 STXBP3O00186 592 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRLRP16471 622 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GUCY2DQ02846 1103 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ITIH3Q06033 890 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PARP10Q53GL7 1025 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ALS2CLQ60I27 953 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 STX8Q9UNK0 236 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ADAMTS2O95450 1211 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 UBE4AQ14139 1066 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CUEDC2Q9H467 287 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ATP6V1AP38606 617 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GUCY1A3Q02108 690 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CFAP58Q5T655 872 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BARHL2Q9NY43 387 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FTCDO95954 541 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NAPAP54920 295 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRRC41Q15345 812 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CAVIN3Q969G5 261 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NOX5Q96PH1 765 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CAPN7Q9Y6W3 813 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TXKP42681 527 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MNAT1P51948 309 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GRM4Q14833 912 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRADDQ15628 312 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ERFEQ4G0M1 354 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC44A5Q8NCS7 719 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LAD1O00515 517 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRPHP41219 470 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SKOR1P84550 965 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AMPD3Q01432 767 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAN2A1Q16706 1144 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CENPPQ6IPU0 288 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IFT20Q8IY31 132 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GLIS3Q8NEA6 775 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF233A6NK53 670 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MCTP2Q6DN12 878 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 POTEDQ86YR6 584 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BAP1Q92560 729 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms