RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 STAP2Q9UGK3 403 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 EXOC7Q9UPT5 735 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 DNM3Q9UQ16 869 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX14Q9Y5W7 946 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MED23Q9ULK4 1368 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 POTEB3A0JP26 581 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RGL2O15211 777 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FDX1P10109 184 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RASSF7Q02833 373 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PPFIA1Q13136 1202 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 BIRC2Q13490 618 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 POTEBQ6S5H4 581 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF169Q8NCN4 708 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PHKBQ93100 1093 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HAUS1Q96CS2 278 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FNBP1Q96RU3 617 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC68Q9H2F9 335 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 YY1AP1Q9H869 796 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MRFAP1Q9Y605 127 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.86□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 BCL9O00512 1426 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ENTPD3O75355 529 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINI2O75830 405 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SKOR1P84550 965 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXO4P98177 505 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC38Q5R3I4 469 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 GALNT17Q6IS24 598 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PIK3R5Q8WYR1 880 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SYNCQ9H7C4 482 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L15C9J2P7 530 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L13C9JLJ4 530 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L11C9JVI0 530 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L18D6R9N7 530 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L22D6RA61 530 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L19D6RCP7 530 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L20D6RJB6 530 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 BIN1O00499 593 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MAN1A2O60476 641 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CSF1RP07333 972 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CETPP11597 493 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ESRRGP62508 458 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SPAG1Q07617 926 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L24Q0WX57 530 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 STX1AQ16623 288 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MUM1Q2TAK8 710 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ICE2Q659A1 982 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ABI1Q8IZP0 508 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ARMC2Q8NEN0 867 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM151AQ8WW52 585 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 OSBP2Q969R2 916 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 DTNBP1Q96EV8 351 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PLIN2Q99541 437 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ADPGKQ9BRR6 497 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TEKT3Q9BXF9 490 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 VPS33BQ9H267 617 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms