RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 MIIPQ5JXC2 388 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT79Q5XKE5 535 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC37A4O43826 429 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 HERVK_113P62684 666 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 PSMD2Q13200 908 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 RAD54LQ92698 747 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 MYMKA6NI61 221 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 RASSF10A6NK89 507 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 TDP2O95551 362 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 MCM6Q14566 821 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 ST7Q9NRC1 585 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 ERLIN1O75477 346 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 FUT8Q9BYC5 575 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 USP40Q9NVE5 1235 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 RIMBP2O15034 1052 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT86O43790 486 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 EDIL3O43854 480 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 SASH3O75995 380 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 LONRF2Q1L5Z9 754 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 KIAA1328Q86T90 577 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 CUL5Q93034 780 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC63Q05C16 580 aa25.73■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.73■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.73■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 HLA-DOAP06340 250 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 TNNI2P48788 182 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 SEPT2Q15019 361 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 SHMT1P34896 483 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 CERS5Q8N5B7 392 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 VWA3BQ502W6 1294 aa25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 GBP3Q9H0R5 595 aa25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 ZBTB5O15062 677 aa25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 MTMR8Q96EF0 704 aa25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC17Q96LX7 622 aa25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 F8W031 263 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC26A4O43511 780 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 MAN2A1Q16706 1144 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 EHD4Q9H223 541 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 AFF2P51816 1311 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP2K7O14733 419 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 KLK7P49862 253 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 HPS3Q969F9 1004 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 TSG101Q99816 390 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 POTEMA6NI47 508 aa25.69■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 EHHADHQ08426 723 aa25.69■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC96Q2M329 555 aa25.69■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 NDST4Q9H3R1 872 aa25.69■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 DYMQ7RTS9 669 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 TEKT1Q969V4 418 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 UBE2SQ16763 222 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 HDXQ7Z353 690 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 PROM2Q8N271 834 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX12PQ92771 950 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-202ENST00000399409 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms