RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 HDAC3O15379 428 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 MTX1Q13505 466 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 BCRP11274 1271 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 FNTAP49354 379 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM17Q9Y577 477 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM24O75264 130 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 INAQ16352 499 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR44Q5JSH3 913 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PLVAPQ9BX97 442 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 DSEQ9UL01 958 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 PLSCR1O15162 318 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ASAP2O43150 1006 aa7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC10P48553 1259 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 P3H1Q32P28 736 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ILDR2Q71H61 639 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 XAGE2Q96GT9 111 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TSGA13Q96PP4 275 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ANO10Q9NW15 660 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 DTX3Q8N9I9 347 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC26Q8NHZ8 85 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ACAP3Q96P50 834 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 POM121CA8CG34 1229 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D8O95759 1140 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKACBP22694 351 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 HNF1BP35680 557 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 HSD17B2P37059 387 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TNNI3KQ59H18 835 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 PIP5K1CO60331 668 aa7.52□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 MAJINQ3KP22 176 aa7.52□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.52□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 BATF3Q9NR55 127 aa7.52□□□□□ -1.2
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