RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376180.7

ITGBL1-202, Transcript of integrin subunit beta like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGBL1, Length 2,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGBL1-202ENST00000376180 CEP89Q96ST8 783 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGBL1-202ENST00000376180 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGBL1-202ENST00000376180 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ITGBL1-202ENST00000376180 NUP58Q9BVL2 599 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGBL1-202ENST00000376180 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGBL1-202ENST00000376180 JADE2Q9NQC1 790 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGBL1-202ENST00000376180 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGBL1-202ENST00000376180 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 BICDL2A1A5D9 508 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 NARFQ9UHQ1 456 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 GNGT1P63211 74 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 RETREG2Q8NC44 543 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 SMCO2A6NFE2 343 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 IQCEQ6IPM2 695 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 IDEP14735 1019 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 NT5C2P49902 561 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 FBXW10Q5XX13 1052 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF263O14978 683 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 MNAT1P51948 309 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 GBP6Q6ZN66 633 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 GRIN2DO15399 1336 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 SNED1Q8TER0 1413 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 BAG3O95817 575 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 INPP5BP32019 993 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 NEK8Q86SG6 692 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 ANO9A1A5B4 782 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 GOLGA8KD6RF30 607 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 PPP4CP60510 307 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 POTEDQ86YR6 584 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 TBCKQ8TEA7 893 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 BARGINQ6ZT62 677 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 EYA3Q99504 573 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 C6orf50Q9HD87 102 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 LRWD1Q9UFC0 647 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 SAMM50Q9Y512 469 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 A0A1W2PQJ5 194 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 VAV2P52735 878 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 FIGNQ5HY92 759 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 TMEM260Q9NX78 707 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 EPHB6O15197 1021 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 RGL2O15211 777 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 ZPR1O75312 459 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CDK8P49336 464 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 GSTO1P78417 241 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 NFIXQ14938 502 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 PIGSQ96S52 555 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 GNA11P29992 359 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 USP8P40818 1118 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGBL1-202ENST00000376180 TXKP42681 527 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms