RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 PIM2Q9P1W9 311 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 FAM170AA1A519 330 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 NR5A1Q13285 461 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 CDK8P49336 464 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 KRT71Q3SY84 523 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 HAUS1Q96CS2 278 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 AKT3Q9Y243 479 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 ELF2Q15723 593 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 ATP2A3Q93084 1043 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 DESI2Q9BSY9 194 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 VPS37BQ9H9H4 285 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 SPON1Q9HCB6 807 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 STK17AQ9UEE5 414 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 STAM2O75886 525 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 TBC1D8O95759 1140 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 MMP1P03956 469 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 ADRA2BP18089 450 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 APOL6Q9BWW8 343 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 HYOU1Q9Y4L1 999 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 COPB1P53618 953 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PODNQ7Z5L7 613 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 SLFN14P0C7P3 912 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PPFIA1Q13136 1202 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PPP2R5CQ13362 524 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PGBD1Q96JS3 809 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 MYO1FO00160 1098 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 KRIT1O00522 736 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV5-2P06315 115 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 CEP57Q86XR8 500 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PPFIBP2Q8ND30 876 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 DISC1Q9NRI5 854 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 MAN1A1P33908 653 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 P3H4Q92791 437 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 MCAMP43121 646 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 MFAP3P55082 362 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 MYL1P05976 194 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 VPS41P49754 854 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 CUL4AQ13619 759 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 DENND2CQ68D51 928 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 EEPD1Q7L9B9 569 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PALM2Q8IXS6 379 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 ACCSQ96QU6 501 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-202ENST00000366197 PIK3CAP42336 1068 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-202ENST00000366197 VSIG1Q86XK7 387 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-202ENST00000366197 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-202ENST00000366197 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-202ENST00000366197 STMN2Q93045 179 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-202ENST00000366197 P2RX5Q93086 422 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-202ENST00000366197 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-202ENST00000366197 ABCC12Q96J65 1359 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-202ENST00000366197 BUB1O43683 1085 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-202ENST00000366197 GH2P01242 217 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms