RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.88■□□□□ 0.93
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SPNS1-204ENST00000352260 F5H6K3 240 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 AFMP43652 599 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 KLRC3Q07444 240 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
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SPNS1-204ENST00000352260 GMCL1Q96IK5 515 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.87■□□□□ 0.93
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SPNS1-204ENST00000352260 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.86■□□□□ 0.93
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SPNS1-204ENST00000352260 DPYDQ12882 1025 aa20.86■□□□□ 0.93
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SPNS1-204ENST00000352260 TMEM139Q8IV31 216 aa20.85■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.85■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 MLKLQ8NB16 471 aa20.85■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 CUL5Q93034 780 aa20.85■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.85■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.85■□□□□ 0.93
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SPNS1-204ENST00000352260 CASP1P29466 404 aa20.84■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.84■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.84■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.84■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 PP2D1A8MPX8 630 aa20.84■□□□□ 0.93
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SPNS1-204ENST00000352260 SERPINC1P01008 464 aa20.84■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 MAGEA9P43362 315 aa20.84■□□□□ 0.93
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SPNS1-204ENST00000352260 LMAN1P49257 510 aa20.83■□□□□ 0.93
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SPNS1-204ENST00000352260 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 DISC1Q9NRI5 854 aa20.83■□□□□ 0.93
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.83■□□□□ 0.93
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SPNS1-204ENST00000352260 TNNI2P48788 182 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 GNG11P61952 73 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 ICE2Q659A1 982 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 POTEDQ86YR6 584 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 CEP112Q8N8E3 955 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 MTRQ99707 1265 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.82■□□□□ 0.92
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SPNS1-204ENST00000352260 TMEM232C9JQI7 657 aa20.82■□□□□ 0.92
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SPNS1-204ENST00000352260 GSDMAQ96QA5 445 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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SPNS1-204ENST00000352260 UBA7P41226 1012 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 ECE1P42892 770 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.923e-12■■■■■ 43.2
SPNS1-204ENST00000352260 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 ACER1Q8TDN7 264 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 SNAP25P60880 206 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 RASSF7Q02833 373 aa20.8■□□□□ 0.92
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