RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 RRAGAQ7L523 313 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 MREGQ8N565 214 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 AGAP11Q8TF27 550 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 EBF2Q9HAK2 575 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 GGT7Q9UJ14 662 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF844Q08AG5 666 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 KRT71Q3SY84 523 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 RETREG2Q8NC44 543 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 THAP9Q9H5L6 903 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 H7C1W4 665 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PALMO75781 387 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ADD2P35612 726 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 GNPTABQ3T906 1256 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ARMC3Q5W041 872 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 C3orf20Q8ND61 904 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF570Q96NI8 536 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 F8W031 263 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 EPHB6O15197 1021 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 CAND2O75155 1236 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 DRD4P21917 467 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SLC1A4P43007 532 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 MCAMP43121 646 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ICA1Q05084 483 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 BIRC3Q13489 604 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 LPIN2Q92539 896 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 LRRC45Q96CN5 670 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SHISA4Q96DD7 197 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 TLDC2A0PJX2 215 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ORC4O43929 436 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 BMP15O95972 392 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 LTKP29376 864 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ERVK-9P63128 1117 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 P3H4Q92791 437 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SWAP70Q9UH65 585 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 PXDNQ92626 1479 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 C5orf60A6NFR6 353 aa6.92□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 SMIM23A6NLE4 172 aa6.92□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 LRRC53A6NM62 1247 aa6.92□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 GHRP10912 638 aa6.92□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 FLT3P36888 993 aa6.92□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 KCNJ2P63252 427 aa6.92□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 TNNC1P63316 161 aa6.92□□□□□ -1.3
LRRN3-201ENST00000308478 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms