RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306823.10

GPS1-201, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPS1, Length 1,842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-201ENST00000306823 SNAP25P60880 206 aa20.32■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 STK4Q13043 487 aa20.32■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 MCM6Q14566 821 aa20.32■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.32■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 KRT79Q5XKE5 535 aa20.32■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 MBOAT7Q96N66 472 aa20.32■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CNTNAP1P78357 1384 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 OGFOD1Q8N543 542 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 RAD54LQ92698 747 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ANO3Q9BYT9 981 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.31■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ZSCAN12O43309 604 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 FCER1AP12319 257 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CCNE1P24864 410 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 PPP1R2P41236 205 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 BAG6P46379 1132 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 MMP14P50281 582 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 AP3B2Q13367 1082 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 FBXO11Q86XK2 927 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 GJA10Q969M2 543 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 MFAP3LO75121 409 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 GYPCP04921 128 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ECM1Q16610 540 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 MCTP2Q6DN12 878 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 KCNK18Q7Z418 384 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 P2RX5Q93086 422 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.842e-6■■■■□ 23.1
GPS1-201ENST00000306823 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 HYIQ5T013 277 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 UNC13DQ70J99 1090 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 TRIM47Q96LD4 638 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 FECHP22830 423 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CASP14P31944 242 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ECE1P42892 770 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 TMX2Q9Y320 296 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 BICDL2A1A5D9 508 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 MARCH6O60337 910 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ACER1Q8TDN7 264 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 HPS3Q969F9 1004 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CCDC51Q96ER9 411 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 OPLAHO14841 1288 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ARHGAP4P98171 946 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 UBXN1Q04323 297 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 SYCP1Q15431 976 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 USH1GQ495M9 461 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CNGA4Q8IV77 575 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-201ENST00000306823 LGALS16A8MUM7 142 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-201ENST00000306823 TBC1D12O60347 775 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-201ENST00000306823 DYMQ7RTS9 669 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-201ENST00000306823 NIM1KQ8IY84 436 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-201ENST00000306823 MB21D1Q8N884 522 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-201ENST00000306823 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
GPS1-201ENST00000306823 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-201ENST00000306823 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-201ENST00000306823 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-201ENST00000306823 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GPS1-201ENST00000306823 SLC26A4O43511 780 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms