RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 USP17L24Q0WX57 530 aa14.88□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 LCORLQ8N3X6 602 aa14.87□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.86□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.86□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 NEDD9Q14511 834 aa14.86□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.86□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.86□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.85□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF18P17022 549 aa14.85□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.85□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 TSKSQ9UJT2 592 aa14.85□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 FDX1P10109 184 aa14.85□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 PTK2Q05397 1052 aa14.85□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 FYB2Q5VWT5 728 aa14.84□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 CETPP11597 493 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 FCGRTP55899 365 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 ADAM9Q13443 819 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 STYK1Q6J9G0 422 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 NFIXQ14938 502 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 CEP57Q86XR8 500 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 ACAD9Q9H845 621 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 TRAPPC10P48553 1259 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 HUNKP57058 714 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.84□□□□□ -0.03
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