RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 CDC23Q9UJX2 597 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 AMFRQ9UKV5 643 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CRB1P82279 1406 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 IKBKBO14920 756 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 RPS6KA4O75676 772 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GFPT2O94808 682 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 MOCS3O95396 460 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TUBBP07437 444 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 BMP3P12645 472 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PPP2R5CQ13362 524 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 Q3C1V9 767 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TRIM58Q8NG06 486 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 DEPTORQ8TB45 409 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 MXD3Q9BW11 206 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 IFNAR2P48551 515 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GRAPQ13588 217 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN26Q16670 478 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CERS3Q8IU89 383 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 VSTM4Q8IW00 320 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CNKSR1Q969H4 720 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CABS1Q96KC9 395 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 REREQ9P2R6 1566 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ALKQ9UM73 1620 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ZNF609O15014 1411 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 USP17L10C9JJH3 530 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 E7EVH7 732 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 E9PMD0 336 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 KRT15P19012 456 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PRCPP42785 496 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 LIG4P49917 911 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GRIN1Q05586 938 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PAK2Q13177 524 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PDIA6Q15084 440 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TXNRD1Q16881 649 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CASC4Q6P4E1 433 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CCDC17Q96LX7 622 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 COX16Q9P0S2 106 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TRPC6Q9Y210 931 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NOD1Q9Y239 953 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 VGLL3A8MV65 326 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TDP2O95551 362 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 BAG6P46379 1132 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 C2orf54Q08AI8 447 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SNX1Q13596 522 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NFIXQ14938 502 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 DDX12PQ92771 950 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 RNF34Q969K3 372 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CCDC51Q96ER9 411 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 MMS19Q96T76 1030 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 APOL6Q9BWW8 343 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 DISC1Q9NRI5 854 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CPDO75976 1380 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms