RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 PDHXO00330 501 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CYP2C8P10632 490 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 UBXN2AP68543 259 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 PNMA3Q9UL41 463 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 PRPHP41219 470 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CALCRLQ16602 461 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 RGMBQ6NW40 437 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 USP49Q70CQ1 688 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 HPSEQ9Y251 543 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CYP3A4P08684 503 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CYP3A7P24462 503 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 MBOAT7Q96N66 472 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 MTMR9Q96QG7 549 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 RPTORQ8N122 1335 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 FAM86B1E9PN63 330 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 TOMM70O94826 608 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CHST13Q8NET6 341 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 EPSTI1Q96J88 318 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 PTPN18Q99952 460 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 KINO60870 393 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CIITAP33076 1130 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 ZNF76P36508 570 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 SYKP43405 635 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CAMK4Q16566 473 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 PRR16Q569H4 304 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 SLC10A3P09131 477 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 TXKP42681 527 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 Q4G0T1 1027 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 IL31RAQ8NI17 732 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 HAS1Q92839 578 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 GJA10Q969M2 543 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 LENG9Q96B70 501 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 UIMC1Q96RL1 719 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 PLXNB2O15031 1838 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-201ENST00000259239 SYCE3A1L190 88 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 ZNF202O95125 648 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 Q3C1V9 767 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 RMDN3Q96TC7 470 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 FBXO40Q9UH90 709 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 ERCC3P19447 782 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 TECP42680 631 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 ERVK-9P63128 1117 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 ERVK-24P63145 666 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 TNMDQ9H2S6 317 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 PXMP2Q9NR77 195 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
IMP4-201ENST00000259239 PP2D1A8MPX8 630 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms