RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tfr2Q9JKX3 798 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm7168A0AUV4 508 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcdha4O88689 947 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pde4aO89084 844 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mmp14P53690 582 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 B4galnt4Q766D5 1034 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sdccag8Q80UF4 717 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sass6Q80UK7 654 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scfd2Q8BTY8 684 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpsm2Q8VDU0 679 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klhl10Q9D5V2 608 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa22.09■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mroh8E9PYI4 1049 aa22.09■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa22.09■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa22.09■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dppa3Q8QZY3 150 aa22.09■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AacsQ9D2R0 672 aa22.09■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Syce1Q9D495 329 aa22.09■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MsnP26041 577 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prpf40bQ80W14 870 aa22.08■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Camkk2Q8C078 588 aa22.08■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Shtn1Q8K2Q9 631 aa22.08■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Anapc4Q91W96 807 aa22.08■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa22.08■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ankrd35E9Q9D8 996 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc191J3QQ27 883 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cap1P40124 474 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Xxylt1Q3U4G3 392 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrrc55Q3UY51 311 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrrc36Q3V0M2 755 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vgll2Q8BGW8 322 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ddx19bQ8BZY3 494 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dennd2aQ8C4S8 1000 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpinb12Q9D7P9 423 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tacc2Q9JJG0 1149 aa22.08■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 LdhbP16125 334 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lamb3Q61087 1168 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kbtbd13Q8C828 458 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MyripQ8K3I4 856 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kbtbd4Q8R179 534 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tph1P17532 447 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abcb4P21440 1276 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 LdhdQ7TNG8 484 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnph1Q80VJ3 173 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxo28Q8BIG4 368 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Havcr2Q8VIM0 281 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc105Q9D4K7 499 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cmtm5Q9D6G9 156 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tgm5Q9D7I9 724 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 FosP01101 380 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prl2c3P04768 224 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tal1P22091 329 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hoxa11P31311 313 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mettl14Q3UIK4 456 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Foxd1Q61345 456 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Senp6Q6P7W0 1132 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrrc41Q8K1C9 807 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ndfip2Q91ZP6 311 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nap1l5Q9JJF0 156 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnajb6O54946 365 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psen2Q61144 448 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cep95Q8BVV7 827 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snapc2Q91XA5 359 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klhl40Q9D783 621 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm45208A0A140LJ36 292 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Esr2O08537 530 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Traf1P39428 409 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmc2P46471 433 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tpm1P58771 284 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gbp7Q91Z40 638 aa22.05■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CatspereP0DP43 985 aa22.04■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rgl1Q60695 768 aa22.04■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sp4Q62445 782 aa22.04■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hirip3Q8BLH7 601 aa22.04■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rab3il1Q8VDV3 383 aa22.04■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PfasQ5SUR0 1337 aa22.04■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Churc1Q6DG52 112 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9DAQ4 598 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnq2Q9Z351 759 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MtrA6H5Y3 1253 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.3 ms