RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000642113.1

TMC3-AS1-207, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

BASIC

Gene TMC3-AS1, Length 2,043 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TIAM1Q13009 1591 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FANCAO15360 1455 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.18■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PLCH2O75038 1416 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NEO1Q92859 1461 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PREX2Q70Z35 1606 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.15■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.15■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.15■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-207ENST00000642113 AKNAQ7Z591 1439 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZBTB22O15209 634 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.13■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RAPGEF3O95398 923 aa16.13■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RICTORQ6R327 1708 aa16.12■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ADGRL1O94910 1474 aa16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MAP3K1Q13233 1512 aa16.08■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-207ENST00000642113 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.08■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NCOA2Q15596 1464 aa16.08■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.07■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.07■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.06■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.06■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCC1P33527 1531 aa16.04■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.04■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 APLP2Q06481 763 aa16.04■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.03■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.01■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 AFAP1Q8N556 730 aa16.01■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KDM5CP41229 1560 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.96■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-207ENST00000642113 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.92■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCA6Q8N139 1617 aa15.92■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.92■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.91■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.91■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.91■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MBD5Q9P267 1494 aa15.91■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.9■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.89■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.88■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ATP7AQ04656 1500 aa15.87■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MIA2Q96PC5 1412 aa15.86■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.86■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ATP10AO60312 1499 aa15.86■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.85■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.85■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.84■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.84■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.83■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MLECQ14165 292 aa15.82■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.82■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MADDQ8WXG6 1647 aa15.81■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.8■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-207ENST00000642113 REREQ9P2R6 1566 aa15.8■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.78■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PLXNC1O60486 1568 aa15.77■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCC5O15440 1437 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 A2MP01023 1474 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TSPY4P0CV99 314 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TSPY10P0CW01 314 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DAPK1P53355 1430 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 AGLP35573 1532 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms