RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R37	O75864	691 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFHC1-223	ENST00000636616	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	9.62	□□□□□ -0.87
EFHC1-223	ENST00000636616	POTEF	A5A3E0	1075 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IER5L	Q5T953	404 aa		9.6	□□□□□ -0.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ARX	Q96QS3	562 aa		9.59	□□□□□ -0.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	9.56	□□□□□ -0.88
EFHC1-223	ENST00000636616	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	9.54	□□□□□ -0.88
EFHC1-223	ENST00000636616	OCEL1	Q9H607	264 aa		9.54	□□□□□ -0.88
EFHC1-223	ENST00000636616	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		9.53	□□□□□ -0.88
EFHC1-223	ENST00000636616	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		9.53	□□□□□ -0.88
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCG2	P16885	1265 aa		9.52	□□□□□ -0.89
EFHC1-223	ENST00000636616	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		9.5	□□□□□ -0.89
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC24B	O95487	1268 aa		9.49	□□□□□ -0.89
EFHC1-223	ENST00000636616	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		9.47	□□□□□ -0.89
EFHC1-223	ENST00000636616	MICALL2	Q8IY33	904 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFHC1-223	ENST00000636616	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SNPH	O15079	494 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFHC1-223	ENST00000636616	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
EFHC1-223	ENST00000636616		G3V3G9	751 aa		9.42	□□□□□ -0.9
EFHC1-223	ENST00000636616	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		9.41	□□□□□ -0.9
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE4A	P27815	886 aa		9.41	□□□□□ -0.9
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR70	Q9NW82	654 aa		9.41	□□□□□ -0.9
EFHC1-223	ENST00000636616	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		9.4	□□□□□ -0.9
EFHC1-223	ENST00000636616	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		9.38	□□□□□ -0.91
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		9.38	□□□□□ -0.91
EFHC1-223	ENST00000636616	MARVELD3	Q96A59	401 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFHC1-223	ENST00000636616	MFSD10	Q14728	455 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFHC1-223	ENST00000636616	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
EFHC1-223	ENST00000636616	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		9.34	□□□□□ -0.91
EFHC1-223	ENST00000636616	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		9.34	□□□□□ -0.91
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
EFHC1-223	ENST00000636616	TMC2	Q8TDI7	906 aa		9.33	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf72	A6NCS6	295 aa		9.31	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF3C	O14782	793 aa		9.31	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		9.31	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	E2F4	Q16254	413 aa		9.3	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		9.3	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		9.3	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	P3H3	Q8IVL6	736 aa		9.3	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		9.29	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		9.29	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	EMP3	P54852	163 aa		9.28	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXK1	P85037	733 aa		9.28	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	DSG2	Q14126	1118 aa		9.28	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	NBR1	Q14596	966 aa		9.28	□□□□□ -0.92
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
EFHC1-223	ENST00000636616	CAMK2B	Q13554	666 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFHC1-223	ENST00000636616	PLPP6	Q8IY26	295 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
EFHC1-223	ENST00000636616	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFHC1-223	ENST00000636616	POTEB3	A0JP26	581 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFHC1-223	ENST00000636616	POTEB	Q6S5H4	581 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFHC1-223	ENST00000636616	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFHC1-223	ENST00000636616	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
EFHC1-223	ENST00000636616	C14orf37	Q86TY3	774 aa		9.18	□□□□□ -0.94
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM205C	A6NFA0	338 aa		9.15	□□□□□ -0.94
EFHC1-223	ENST00000636616	DPYSL4	O14531	572 aa		9.14	□□□□□ -0.95
EFHC1-223	ENST00000636616	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		9.14	□□□□□ -0.95
EFHC1-223	ENST00000636616	OXER1	Q8TDS5	423 aa		9.13	□□□□□ -0.95
EFHC1-223	ENST00000636616	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	9.12	□□□□□ -0.95
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC34A2	O95436	690 aa		9.11	□□□□□ -0.95
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K9	P80192	1104 aa		9.11	□□□□□ -0.95
EFHC1-223	ENST00000636616	SEMA3E	O15041	775 aa		9.1	□□□□□ -0.95
EFHC1-223	ENST00000636616	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
EFHC1-223	ENST00000636616	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFHC1-223	ENST00000636616	PDIA6	Q15084	440 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFHC1-223	ENST00000636616	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D12	O60347	775 aa		9.07	□□□□□ -0.96
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	9.05	□□□□□ -0.96
EFHC1-223	ENST00000636616	DOK7	Q18PE1	504 aa		9.04	□□□□□ -0.96
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		9.04	□□□□□ -0.96
EFHC1-223	ENST00000636616	EVI5	O60447	810 aa		9.03	□□□□□ -0.96
EFHC1-223	ENST00000636616	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.96
EFHC1-223	ENST00000636616	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	9.02	□□□□□ -0.96
EFHC1-223	ENST00000636616	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	PTGER2	P43116	358 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	RIMBP2	O15034	1052 aa		9	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		8.99	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		8.99	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		8.99	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	ARSI	Q5FYB1	569 aa		8.98	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		8.98	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		8.98	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	8.98	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR153	Q6NV75	609 aa		8.98	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		8.97	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	8.97	□□□□□ -0.97
EFHC1-223	ENST00000636616	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	8.96	□□□□□ -0.98
EFHC1-223	ENST00000636616	NUDT7	P0C024	238 aa		8.95	□□□□□ -0.98
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX12P	Q92771	950 aa		8.95	□□□□□ -0.98
EFHC1-223	ENST00000636616	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		8.94	□□□□□ -0.98
EFHC1-223	ENST00000636616	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	8.94	□□□□□ -0.98
EFHC1-223	ENST00000636616	OSBP	P22059	807 aa		8.93	□□□□□ -0.98

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